Der erste Versuch an einer Fortsetzung zum ersten Resident Evil Teil, war zu 80% fertig gewesen, als Capcom diese einen Monat vor dem PSX Release auf Eis legte. Die Crew gruppierte sich zusammen um das Projekt von vorn zu beginnen. Man nahm Charaktere vom ersten Versuch, z.B Leon S. Kennedy & Marvin Branagh (Der sterbende Polizist am Anfang des Spiels. Branagh war ursprünglich vorgesehen, gemeinsam mit Ada, Leon zu helfen und mit ihnen zu überleben.
Bei der Prototyp-Version gab es auch eine Elza Walker, die in der finalen Version durch
Claire Redfield ausgetauscht wurde (beide Charaktere ähneln sich stark).

Robert Kendo (der Waffenverkäufer) sollte eigentlich in der alten Version eine wichtige Rolle im Drehbuch von Elza Walker spielen. Brian Irons, der Hauptkommissar der R.P.D, spielte auch schon in der alten Version eine Rolle, jedoch nicht die, die er in der veröffentlichten Version spielt.
Auch hat sich das Polizeigebäude verändert, in der alten Version war es wesentlich moderner, was in der endgültigen Version mehr einen eher heruntergekommen Charakter aufwies. Der Prototyp zeigte schon Abwasserleitungen, Gefängnis und Laborgebiete, wovon einige in die spätere Version übernommen wurden. In der ursprünglichen Fassung gab es z.B Menschenspinnen, Zombieaffen, optisch anders aussehende Zombie-Polizisten. Auch der
G-Mutant, sowie die Birkin Mutationen sahen etwas anders aus.

Zudem konnte man Handgranaten werfen und neue Rüstungen finden. Ursprünglich war geplant, dass die Blutspritzer von Feinden an den Charakteren haftenbleiben, wenn man diese aus naher Distanz abschiesst. Auch gab es Probleme mit den Drehbüchern, da die Story der beiden Charaktere nicht ineinander übergreifen würde.
Die einzige spielbare Demo war in der japanischen Version von Resident Evil: Directors Cut dabei.